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감면대상 고가주택 양도세는 어떻게 계산하나?
2년 이상 보유한 감면대상 주택은 1세대 1주택으로 보며, 고가주택이면 소득세법 규정을 적용한 뒤 감면 규정을 적용한다.
감면대상 주택의 비과세, 고가주택 세액 계산, 농어촌특별세 및 보유기간 기산일을 물었다. 2년 이상 보유한 감면대상 주택은 1세대 1주택으로 보며, 고가주택이면 소득세법 규정을 적용한 뒤 감면 규정을 적용한다. 감면세액의 20%는 농어촌특별세로 납부하지만 비과세 양도소득은 과세대상이 아니며, 보유기간은 취득일부터 계산한다.
회신 당시 법령을 기준으로 한 국세청 공식 해석의 요약이다. 내 사정에 적용하려면 아래 원문 전문과 근거 조문, 회신 이후 개정 여부를 함께 본다.
인용 법령이 회신 이후 개정·시행됐다. 현재 조문과 대조가 필요하다. 회신 이후 개정 시행: 농어촌특별세법(2026.05.12 시행), 소득세법 시행령(2026.07.01 시행), 소득세법(2026.07.01 시행), 조세특례제한법(2026.07.01 시행) 회신일 기준 판단이며 이후 법령 개정·판례로 결론이 달라질 수 있다.
사실관계
1세대가 「조세특례제한법」상 감면대상 주택 1개를 2년 이상 보유한 뒤 양도하는 경우이다. 해당 주택이 1세대 1주택이면서 고가주택인 경우도 함께 검토되었다.
질의요지
1세대가 양도하는 조특법 제99조의 2제1항에 해당하는 1개의 감면대상 주택이 고가주택에 해당하는 경우 「소득세법」제95조제3항 및 같은 법 시행령 제160조를 적용한 후「조세특례제한법」제99조의 2제1항의 규정을 적용하는 것임
회답
부동산납세과-269
본문(원문)
1. 1세대가 「조세특례제한법」제99조의 2제1항에 해당하는 1개의 감면대상 주택을 2년 이상 보유하고 양도할 때에는 이를 1세대1주택으로 보아 「소득세법 시행령」제154조제1항을 적용하는 것이고, 양도하는 감면대상주택이 1세대1주택이면서 고가주택에 해당하는 경우에는 「소득세법」 제95조제3항 및 같은 법 시행령 제160조를 적용한 후「조세특례제한법」제99조의 2제1항의 규정을 적용하는 것입니다.
2. 위 1의 경우, 감면세액의 20%를 「농어촌특별세법」제3조 및 제5조에 따라 농어촌특별세로 납부하는 것이나, 「소득세법」제89조제1항제3호 및 같은 법 시행령 제154조제1항에 따른 비과세 양도소득은 농어촌특별세 과세대상이 아닙니다.
3. 1세대1주택 비과세 적용을 위한 보유기간의 기산일은 취득일이고, 일반분양 받은 아파트의 취득일은 우리 청의 기존해석사례(부동산거래관리과-1113, 2010.08.31)를 참고하시기 바랍니다.
4. 주민세와 관련된 사항은 우리 청 소관이 아니므로 소관 지방자치단체로 문의하시기 바랍니다.
정제 정리
질의
감면대상 주택을 양도할 때 1세대 1주택 비과세와 고가주택 계산 규정, 농어촌특별세 및 보유기간 기산일을 어떻게 적용하는지 여부.
회답
1. 감면대상 주택 1개를 2년 이상 보유하고 양도하면 1세대 1주택으로 보며, 해당 주택이 고가주택이면 「소득세법」의 고가주택 관련 규정을 적용한 후 「조세특례제한법」의 감면 규정을 적용한다.
2. 감면세액의 20%는 「농어촌특별세법」에 따라 농어촌특별세로 납부하나, 비과세 양도소득은 농어촌특별세 과세대상이 아니다.
3. 비과세 적용을 위한 보유기간의 기산일은 취득일이며, 일반분양 아파트의 취득일은 기존 해석사례 부동산거래관리과-1113, 2010.08.31을 참조한다.
4. 주민세는 국세청 소관이 아니므로 소관 지방자치단체에 문의한다.
근거 법령·조문 govbrief.kr 조문 페이지로 연결
- 조세특례제한법 제99의2조제1항 (신축주택 등 취득자에 대한 양도소득세의 과세특례) 조문 원문 govbrief.kr 이 조문을 인용한 다른 해석
- 소득세법 제95조제3항 (양도소득금액과 장기보유 특별공제액) 조문 원문 govbrief.kr 이 조문을 인용한 다른 해석
- 소득세법 제160조 (장부의 비치ㆍ기록) 조문 원문 govbrief.kr 이 조문을 인용한 다른 해석
- 소득세법 시행령 제154조제1항 (1세대1주택의 범위) 조문 원문 govbrief.kr 이 조문을 인용한 다른 해석
- 농어촌특별세법 제3조 (납세의무자) 조문 원문 govbrief.kr 이 조문을 인용한 다른 해석
- 농어촌특별세법 제5조 (과세표준과 세율) 조문 원문 govbrief.kr 이 조문을 인용한 다른 해석
- 소득세법 제89조제1항제3호 (비과세 양도소득) 조문 원문 govbrief.kr 이 조문을 인용한 다른 해석
- 소득세법 제154조제1항 (원천징수의 면제) 조문 원문 govbrief.kr 이 조문을 인용한 다른 해석
같은 법령·조문을 다룬 심판결정
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공통 조문을 다뤘다는 구조 연결이다. 동일 질문·동일 사실관계·동일 결론을 뜻하지 않는다. 전체 254건 중 최신 12건을 표시한다.
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이 답을 인용할 때
국세청 법령해석 서면-2016-부동산-2780 (2016.02.25 회신), "감면대상 고가주택 양도세는 어떻게 계산하나?", GovBrief 국세, https://tax.govbrief.kr/d/nts_cgm/010000000000214795/
출처·편집 정보
- 원문
- 국가법령정보센터 국세청 회신 목록(기관 원문 연결) (식별자 010000000000214795)
- 원 제목
- 1세대가 조특법 제99조의2에 해당하는 1개의 감면대상 주택을 양도할 때 비과세 등
- 공개 등급
- 공개 후보 · 검색 색인 대상
- 편집
- 질문형 제목·3문장 요약·사실관계·정제 정리는 정제 파이프라인 산출물(원문 근거 계약 검사 통과). 법령 해소·현행성은 규칙 기반. 조문 링크는 govbrief.kr에 조문 페이지가 있는 것만 연결.
- 갱신
- 2026-09-09