쟁점토지를 청구인이 자경하지 않았다 하여 비사업용토지로 보아 장기보유특별공제를 배제하여 과세한 처분의 당부
심판청구를 기각한다.
청구인은 한전에서 근무하면서 07~09년에는 제천시 및 의정부시에 소재하는 지점 등에 근무한 것으로 나타나고, 청구인이 제시한 인우보증서, 간이영수증, 농지원부 등은 객관적인 증빙으로 보기 어려우므로 청구인이 쟁점토지를 자경하지 않은 것으로 보아 배제한 처분은 잘못 없음
결정문이 인용한 법령이 의결 이후 개정·시행됐다. 현재 조문과 대조가 필요하다. 의결 이후 개정 시행: 국세기본법(2026.08.11 시행), 농지법(2026.08.28 시행), 소득세법(2026.07.01 시행), 조세특례제한법 시행령(2026.07.01 시행), 한국농어촌공사 및 농지관리기금법(2026.07.07 시행) 이 표시는 결정문에 인용된 법령의 법령 단위 변경 신호이며 결정의 효력이나 현재 사건의 결론을 판정하지 않는다.
탐색 분야
사건명·공식 주문·재결요지·관련 법령에 실제로 나온 문자열로 붙인 탐색용 분류다.
재결요지
청구인은 한전에서 근무하면서 07~09년에는 제천시 및 의정부시에 소재하는 지점 등에 근무한 것으로 나타나고, 청구인이 제시한 인우보증서, 간이영수증, 농지원부 등은 객관적인 증빙으로 보기 어려우므로 청구인이 쟁점토지를 자경하지 않은 것으로 보아 배제한 처분은 잘못 없음
이유
1. 처분개요
가. 청구인은 2005.6.20. OOO 499 전 2,066㎡(이하 “쟁점토지”라 한다)를 취득하여 2009.12.30. 한국토지주택공사에 양도(수용)하고 2010.3.2. 사업용토지로 보아 장기보유특별공제액 42,949,803원을 공제하여 2009년 귀속 양도소득세 68,560,430원을 예정신고납부하였다.
나. 처분청은 청구인이 쟁점토지를 자경하지 않았다 하여 비사업용토지로 보아 장기보유특별공제를 배제하여 2011.1.13. 청구인에게 2009년 귀속 양도소득세 14,148,410원을 경정고지하였다.
다. 청구인은 이에 불복하여 2011.4.13. 이의신청을 거쳐 2011.8.10. 심판청구를 제기하였다.
2. 청구인 주장 및 처분청 의견
가. 청구인 주장
청구인은 쟁점토지의 취득시(2005.6.20)에는 OOO구, 2006.3.27.부터 현재까지는 OOO구에서 거주하는 등 쟁점토지 소재지 인근지역에 거주하였고, 농사 경험이 풍부한 동거가족 8 명이 배추, 무우 등을 경작하여 자가소비 및 친인척에 나누어 주었으며 , 근무지가 출퇴근이 가능한 지역이고 주2회 휴무로 인하여 쟁점토지를 경작하는데 지장이 없었는데도 자경하지 않은 것으로 보아 과세한 처분은 부당하다.
나. 처분청 의견
청구인은 1998년부터 OOO 및 그 산하 발전소에서 근무하고 있으며 쟁점토지 보유기간인 2007 ~ 2009년에는 OOO시, OOO시, OOO시에 소재하는 지점 등에서 근무하였던 것으로 나타나고, 청구인이 제시하고 있는 간이영수증 및 인우보증서 등은 자경에 대한 객관적인 증빙으로 보기 어려우므로 청구인이 쟁점토지를 자경하지 않은 것으로 보아 과세한 처분은 정당하다.
3. 심리 및 판단
가. 쟁점
쟁점토지를 청구인이 자경하지 않았다 하여 비사업용토지로 보아 장기보유특별공제를 배제하여 과세한 처분의 당부
나. 관련법령
(1) 소득세법 제95조 【양도소득금액】
① 양도소득금액은 제94조의 규정에 의한 양도소득의 총수입금액(이하 “양도가액”이라 한다)에서 제97조의 규정에 의한 필요경비를 공제하고, 그 금액(이하 “양도차익”이라 한다)에서 장기보유특별공제액을 공제한 금액으로 한다.
② 제1항에서 "장기보유특별공제액" 이란 제94조 제1항 제1호에 따른 자산(제104조 제1항 제2호의 3부터 제2호의 8까지와 같은 항 제3호에 따른 세율을 적용받는 자산 및 제104조 제6항을 적용받는 자산은 제외한다)으로서 그 자산의 보유기간이 3년 이상인 것에 대하여 해당 자산의 양도차익에 다음 표1에 규정된 보유기간별 공제율을 곱하여 계산한 금액을 말한다.(단서 생략) 표1 보유기간 공제율 3년 이상 4년 미만 100분의 10 4년 이상 5년 미만 100분의 12 (이하 생략) 제104조의3 【비사업용 토지의 범위】
① 제96조 제2항 제8호 및 제104조 제1항 제2호의7에서 “비사업용 토지”라 함은 당해 토지를 소유하는 기간 중 대통령령이 정하는 기간동안 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 토지(이하 이 조에서 “비사업용 토지”라 한다)를 말한다.
1. 전ㆍ답 및 과수원(이하 이 조에서 "농지" 라 한다)으로서 다음 각 목의 어느 하나에 해당하는 것 가. 대통령령이 정하는 바에 의하여 소유자가 농지소재지에 거주하지 아니하거나 자기가 경작하지 아니하는 농지. 다만, 「농지법」 그 밖의 법률에 의하여 소유할 수 있는 농지로서 대통령령이 정하는 경우를 제외한다.
(2) 조세특례제한법 제69조 【자경농지에 대한 양도소득세의 감면】
① 농지소재지에 거주하는 대통령령이 정하는 거주자가 8년 이상[대통령령이 정하는 경영이양직접지불보조금의 지급대상이 되는 농지를 「한국농어촌공사 및 농지관리기금법」에 따른 한국농어촌공사 또는 농업을 주업으로 하는 법인으로서 대통령령이 정하는 법인(이하 이 조에서 “농업법인”이라 한다)에 2010년 12월 31일까지 양도하는 경우에는 3년 이상] 직접 경작한 토지로서 농업소득세의 과세대상(비과세ㆍ감면 및 소액부징수 대상을 포함한다)이 되는 토지 중 대통령령이 정하는 토지의 양도로 인하여 발생하는 소득에 대하여는 양도소득세의 100분의 100에 상당하는 세액을 감면한다.
(3) 소득세법 시행령 제168조의6 【비사업용 토지의 기간기준】 법 제104조의3 제1항 각 호 외의 부분에서 “대통령령이 정하는 기간”이란 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 기간을 말한다.
2. 토지의 소유기간이 3년 이상이고 5년 미만인 경우에는 다음 각 목의 모두에 해당하는 기간 가. 토지의 소유기간에서 3년을 차감한 기간을 초과하는 기간 나. 양도일 직전 3년 중 1년을 초과하는 기간 다. 토지의 소유기간의 100분의 20에 상당하는 기간을 초과하는 기간. 이 경우 기간의 계산은 일수로 한다.
(4) 조세특례제한법 시행령 제66조 【자경농지에 대한 양도소득세의 감면】
① 법 제69조 제1항 본문에서 “농지소재지에 거주하는 대통령령이 정하는 거주자”라 함은 8년[제3항의 규정에 의한 경영이양보조금의 지급대상이 되는 농지를 「한국농촌공사 및 농지관리기금법」에 따른 한국농촌공사(이하 이 조에서 “한국농촌공사”라 한다) 또는 제2항의 규정에 따른 법인에게 양도하는 경우에는 3년] 이상 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 지역(경작개시 당시에는 당해 지역에 해당하였으나 행정구역의 개편 등으로 이에 해당하지 아니하게 된 지역을 포함한다)에 거주하면서 경작한 자를 말한다.
1. 농지가 소재하는 시ㆍ군ㆍ구(자치구인 구를 말한다. 이하 이 항에서 같다)안의 지역
2. 제1호의 지역과 연접한 시ㆍ군ㆍ구안의 지역
3. 해당 농지로부터 직선거리 20킬로미터 이내의 지역
④ 법 제69조 제1항 본문에서 “대통령령이 정하는 토지”라 함은 취득한 때부터 양도할 때까지의 사이에 8년(제3항의 규정에 따른 경영이양보조금의 지급대상이 되는 농지를 한국농촌공사 또는 제2항의 규정에 의한 법인에게 양도하는 경우에는 3년) 이상 자기가 경작한 사실이 있는 농지로서 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 것을 제외한 것을 말한다.
⑬ 법 제69조 제1항에서 "직접 경작" 이라 함은 거주자가 그 소유농지에서 농작물의 경작 또는 다년성(多年性) 식물의 재배에 상시 종사하거나 농작업의 2분의 1 이상을 자기의 노동력에 의하여 경작 또는 재배하는 것을 말한다.
다. 사실관계 및 판단
(1) 청구인이 2005.6.20. 쟁점토지를 취득하여 2009.12.30. 양도하고 사업용토지로 보아 장기보유특별공제액 42,949,803원을 공제하여 양도소득세를 예정신고납부한 것에 대하여 처분청은 비사업용토지로 보아 장기보유특별공제를 배제하여 과세하였음이 경정결의서 등 심리자료에 의하여 확인된다.
(2) 국세청 전산조회 결과에 의하면 청구인은 1998년부터 OOO 및 그 산하의 발전소에서 근로소득이 발생하고 있고, 쟁점토지의 보유기간인 2005 ~ 2009년 근로소득 발생내역은 아래 <표>와 같다. <표> 근로소득 발생내역 (단위 : 천원)
귀속연도
소득발생처(소재지)
수입금액
2009
OOO
92,323
2008
OOO
97,831
2007
OOO
89,527
2006
OOO
92,875
2005
OOO
84,813
(3) 청구인이 제시한 증빙은 아래와 같다. (가) 2007.6.11. 최초로 작성된 농지원부에는 청구인이 쟁점토지를 자경한 것으로 기재되어 있다. (나) 쟁점토지 인근주민인 이남용이 작성한 경작사실확인서(2010.11.19.) 및 인근주민이 작성한 인우보증서에는 청구인이 쟁점토지를 자경한 것으로 기재되어 있다. (다) OOO농원 및 OOO종묘농약사가 발급한 간이영수증에는 무우 씨앗, 상추모종, 퇴비 등으로 115천원을 거래한 것으로 기재되어 있다 .
(4) 살피건대, 청구인은 쟁점토지를 자경하였다고 주장하나, 자경이라 함은 거주자가 그 소유농지에서 농작물의 경작 또는 다년성(多年性) 식물의 재배에 상시 종사하거나 농작업의 2분의 1 이상을 자기의 노동력에 의하여 경작 또는 재배하는 것을 말하는 바, 청구인은 OO OOOO 및 그 산하의 발전소에서 근무하면서 쟁점토지 보유기간 중에 OOO시 및 OOO시에 소재하는 지점 등에 근무한 것으로 나타나고, 청구인이 제시한 인우보증서, 간이영수증, 농지원부 등은 자경에 대한 객관적인 증빙으로 보기 어려우므로 청구인이 쟁점토지를 자경하지 않은 것으로 보아 과세한 처분은 잘못이 없는 것으로 판단된다.
4. 결론
이 건 심판청구는 심리결과 청구주장이 이유 없으므로 「국세기본법」제81조 및 제65조 제1항 제2호에 의하여 주문과 같이 결정한다.
근거 법령·조문
- 소득세법 제95조 (양도소득금액과 장기보유 특별공제액) 조문 원문 govbrief.kr 이 조문을 인용한 다른 해석
- 조세특례제한법 시행령 제66조 (자경농지에 대한 양도소득세의 감면) 조문 원문 govbrief.kr 이 조문을 인용한 다른 해석
- 농지법 법령 페이지 govbrief.kr 이 법령을 인용한 다른 해석
- 한국농어촌공사 및 농지관리기금법 법령 페이지 govbrief.kr 이 법령을 인용한 다른 해석
- 한국농촌공사 및 농지관리기금법
- 국세기본법 제81조 (항고소송 제기사건의 통지) 조문 원문 govbrief.kr
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출처·분류
- 공식 원문
- 국가법령정보센터 조세심판원 결정 (식별자 187904)
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