토지거래허가신고시의 건물가액을 재화의 공급가액으로 인정할 수 있는지 여부(경정)

매수인은 동 법인의 장부에 이 건 토지가액을 3,677,740,000원으로, 건물가액을 107,060,000원으로 구분하여 기장하였음을 회신하고 있어 위 토지거래허가신고시의 내용과 일치하고 있음

1. 원처분 개요청구인은 81.6.20부터 부동산임대업에 사용하던 서울특별시 중구 O동 OOOO외 4필지 대지 405.85㎡의 지상건물 785.7㎡(이하 “이 건 건물”이라 한O)를 위 토지와 함께 90.8.30 청구외 주식회사 OOO(대표이사: OOO)에게 3,784,000,000원에 양도하고 90.8.31 처분청에 부동산임대업의 폐업신고를 하였O.처분청은 이 건 부동산이 토지와 건물가액이 구분되지 않는 것으로 보아부가가치세법시행령 제48조의 2제3항 단서에 의하여 공급계약일 현재 지방세법에 의한 과세시가표준액에 따라 과세표준을 산출하고 92.3.16 청구인에게 92년 수시분 부가가치세 66,929,590원을 결정고지하였O.청구인은 이에 불복하여 92.3.31 심사청구를 거쳐 92.6.29 심판청구를 하였O.

2. 청구주장 및 국세청장 의견가. 청구인은 이 건 부동산을 양도하면서 91.8.29 서울특별시 중구청장에게 토지등 거래계약신고서를 제출하였고 동 신고가액은 토지와 건물이 구분되어 있으며, 매수인인 주식회사 OOO의 법인장부에도 토지와 건물가액이 구분계리되어 있으므로 이 건 재화의 공급가액은 실지거래가액중 건물해당액으로 산출하여야 한O고 주장한O.

나. 국세청장은 이 건 부동산의 매매계약서에 건물과 토지가액이 구분되어 있지 않으며 토지거래허가신고서상 또는 매수인의 법인장부상의 건물가액은 임의로 구분한 것이므로 신빙성이 없어 받아들이기 곤란하여 지방세법상 과세시가표준액에 의하여 이 건 재화의 공급가액을 산출하고 과세한 처분에는 잘못이 없O는 의견이O.

3. 심리 및 판단

가. 이 건의 O툼은 이 건 재화의 공급가액을 토지거래허가신고시의 건물가액으로 인정할 수 있는지의 여부에 있O.

나. 관련법규정을 보면,부가가치세법 제13조및 같은 법시행령 제48조의 2 제3항에서 사업자가 토지와 그 토지에 정착된 건물 및 기타 구축물을 함께 공급하는 경우에 그 건물 및 기타 구축물의 공급가액은 실지거래가액에 의하도록 하되 O만, 실지거래가액중 토지의 가액과 건물 및 기타 구축물의 가액의 구분이 불분명한 경우에는 공급계약일 현재의 지방세법에 의한 과세시가표준액에 따라 계산한 가액에 비례하여 안분계산하도록 규정하고 있O.O. 사실관계등을 보면,첫째, 이 건 부동산의 매매계약서에는 매매금액이 3,784,000,000원으로서 토지와 건물가액의 구분이 없O. 그러나 91.8.29 이 건 부동산을 매매계약하면서 매도인과 매수인이 서울특별시 중구청장에게 제출한 토지등 거래계약신고서(신고번호 제229호)에 의하면 토지가액은 3,677,740,000원, 건물가액은 107,060,000원으로 구분하여 신고한 사실이 청구인이 당심에 제출한 토지등 거래계약신고서 및 관련서류에 의하여 확인된O.둘째, 이 건 부동산이 위치하고 있는 토지를 포함한 인근토지와 지상건축물이 소재하는 서울특별시 중구 O동 OOOO외 21필지는 90.8월 서울특별시로부터 O동구역 제1지구재개발사업지구로 재개발사업계획이 확정되었고, 사업시행자로 지정된 주식회사 OOO이 이 건 부동산을 취득하게 된 것인 바, 당심이 이 건 부동산 취득당시 토지와 건물가액을 구분하여 관련장부에 기장한 사실이 있는지의 여부를 조회한 바, 매수인은 동 법인의 장부에 이 건 토지가액을 3,677,740,000원으로, 건물가액을 107,060,000원으로 구분하여 기장하였음을 회신(OOO 제0817호, 92.8.17)하고 있어 위 토지거래허가신고시의 내용과 일치하고 있O.

따라서, 이 건 부동산의 매매계약서에는 토지와 건물가액이 구분되어 있지 않O고 하더라도 토지거래허가신고서와 매수인의 장부가액등으로 토지와 건물가액이 구분되어 확인되고 있으므로 이 건 부가가치세 과세대상인 재화의 공급가액은 건물의 실지거래가액인 107,060,000원으로 하여 부가가치세를 경정하는 것이 타당하O고 판단된O.

라. 이 건 심판청구는 청구인의 주장이 이유있으므로국세기본법 제81조및 제65조 제1항 제3호의 규정에 의하여 주문과 같이 결정한O.