국가에서 직접 받은 보조금은 부가가치세 과세표준에 포함되는가?

보조사업자가 보조사업을 수행하고 국가 등으로부터 보조금을 직접 교부받는다. 별도로 면세포기신고 사업자가 정부출연금 등을 재원으로 한 연구개발사업에 용역을 제공하고 대가를 받는 경우가 검토되었다.

보조금의 교부대상이 되는 사업자가 보조사업을 수행하고 국가 등으로부터 직접 교부받는 보조금은 부가가치세 과세표준에 포함하지 아니하는 것이나, 면세포기신고를 한 사업자가 동법률에 의한 보조금이 아닌 정부출연금 등을 재원으로 국가 등이 시행하는 연구개발사업에 따라 연구개발용역을 제공하고 그 대가를 받는 경우에는 부가가치세 과세표준에 포함하는 것임.

보조금의예산및관리에관한법률에 의해 보조금의 교부대상이 되는 보조사업을 수행하는 자가 보조사업을 수행하고 국가 등으로부터 직접 교부받는 보조금은 부가가치세 과세표준에 포함하지 아니하는 것이나, 면세포기신고를 한 사업자가 동법률에 의한 보조금이 아닌 정부출연금 등을 재원으로 국가 등이 시행하는 연구개발사업에 따라 연구개발용역을 제공하고 그 대가를 받는 경우에는 부가가치세 과세표준에 포함하는 것입니다.

질의

국가 등으로부터 직접 교부받는 보조금과 연구개발용역 대가가 부가가치세 과세표준에 포함되는지 여부.

회답

보조금의예산및관리에관한법률에 따라 보조금 교부대상이 되는 보조사업을 수행하는 자가 국가 등으로부터 직접 교부받는 보조금은 부가가치세 과세표준에 포함하지 않습니다.

다만, 면세포기신고를 한 사업자가 해당 법률에 따른 보조금이 아닌 정부출연금 등을 재원으로 국가 등이 시행하는 연구개발사업에 따라 연구개발용역을 제공하고 그 대가를 받는 경우에는 부가가치세 과세표준에 포함합니다.

국세청 법령해석 부가46015-2698 (<time datetime="1998-12-08">1998.12.08</time> 회신), "국가에서 직접 받은 보조금은 부가가치세 과세표준에 포함되는가?", GovBrief 국세, https://tax.govbrief.kr/d/nts_cgm/010000000000070425/