지정지역내 공익사업용 부동산에 대한 양도소득세 과세특례 해당여부(기각)

산업단지 사업인정고시일로부터 소급하여 2년 전에 토지를 취득하지 아니하였으므로 기준시가 적용대상이 아닌 것으로 보아 실거래가를 적용하여 과세함

1. 처분개요

청구인은 2003.6.11 OOO OOO OOO OOO OOO 공장용지 2,936㎡, 같은리 306 공장용지 2,010㎡, 같은리 307 공장용지 437㎡(이하 “쟁점토지”라 한다)를 취득하고, 2005.5.30 OOOOOO에 협의매수형식으로 쟁점토지를 양도하였다. 청구인은 쟁점토지의 양도에 관하여 조세특례제한법 제85조 규정에 의한 기준시가 적용대상으로 보아 양도소득세 2005년분 172,862,430원 을 처분청에 신고·납부하였다. 처분청은 쟁점토지의 양도차익을 실지거래가로 산정하여 2006.5.12 청구인에게 양도소득세 2005년분 440,249,620원을 경정·고지하였다. 청구인은 이에 불복하여 2006.6.26 이건 심판청구를 제기하였다.

2. 청구인 주장 및 처분청 의견

가. 청구인 주장

쟁점토지의 산업단지 지정고시일인 2004.9.30이 투기(지정)지역 지정일 2003.8.18 후에 도래하였고, 청구인은 위 지정지역 지정일 이전인 2003.5.2 이미 공매로 쟁점토지를 취득하였고, 쟁점토지는 2005.5.30 공익사업을 위해 당해 사업시행자에게 협의매수(양도)되었는 바, 기준시가에 의한 당초의 예정신고 및 납부는 정당하다.

나. 처분청 의견

산업단지 사업 관련 예정지역지정일이 별도 고시된 사실이 없으므로 조세특례제한법 제85조 의 규정에 의하여 사업인정고시일로부터 소급하여 2년 전에 쟁점토지를 취득하여야 기준시가 과세가 가능하나, 청구인은 사업인정고시일인 2004.9.30로부터 소급하여 2년 전에 쟁점토지를 취득하지 아니하였음이 확인되는 바, 쟁점토지의 양도에 관하여 실지거래가액을 적용한 이건 처분은 적법하다.

3. 심리 및 판단

가. 쟁점

쟁점토지가 조세특례제한법 제85조 의 규정에 의한 기준시가 적용대상이 아니라고 보아 실지거래가를 적용·과세한 처분의 당부

나. 관련법령

(1) 조세특례제한법 제85조 【지정지역내 공익사업용 부동산에 대한 양도소득세 과세특례】 거주자가 소득세법 제96조 제1항 제6호의 2의 규정에 의한 지정지역내의 부동산을 다음 각호의 1에서 규정하고 있는 날(관계 행정기관의 장이 관보 또는 공보에 고시한 날을 말하며, 그 고시한 날이 사업인정고시일부터 소급하여 2년 이내인 경우에는 사업인정고시일부터 소급하여 2년이 되는 날, 그 고시한 날이 소득세법 제96조 제1항 제6호의 2의 규정에 의한 지정지역 지정 후 도래하는 경우에는 지정지역을 지정한 날을 말한다) 전에 취득하여 2006년 12월 31일 이전에 공익사업을위한토지등의취득및보상에관한법률 또는 그 밖의 법률에 의하여 당해 사업시행자에게 양도(수용되는 경우를 포함한다. 이하 이 조에서 같다)하는 경우에는 소득세법 제96조 제1항 제6호의 2 및 동법 제97조 제1항 제1호 가목 단서의 규정에 불구하고 동법의 규정에 의한 양도가액 및 취득가액을 기준시가에 의할 수 있다. 다만, 소득세법 제96조 제1항 제6호 및 동법 제97조 제1항 제1호 가목 단서의 규정에 의하여 양도가액 및 취득가액을 실지거 래가액으로 신고하는 경우에는 그러하지 아니하다. (2004. 12. 31. 신 설)

1. 택지개발촉진법 제3조 의 규정에 의하여 택지개발예정지구를 지정한 날

2. 산업입지및개발에관한법률 제7조의 3 의 규정에 의하여 산업단지 등을 지정한 날

3. 지역균형개발및지방중소기업육성에관한법률 제4조 의 규정에 의하여 광역개발권역을 지정한 날

4. 주한미군(대한민국과미합중국간의상호방위조약에 의하여 대한민국에 주둔하는 미합중국 군대를 말한다)의 기지이전과 관련하여 공익사업을위한토지등의취득및보상에관한법률 제15조 의 규정에 의하여 보상계획을 공고한 날

5. 제1호 내지 제4호 외의 법률에 의하여 양도하는 부동산의 경우에는 당해 법률에 의하여 부동산이 속한 사업지역에 대한 예정지구ㆍ지역, 개발권역 지정，보상계획공고 그밖에 이와 유사한 것으로서 대통령령이 정하는 날

(2) 조세특례제한법시행령 제79조의 2 【지정지역내 공익사업 용 부동산에 대한 양도소득세 과세특례】

① 법 제85조 제5호에서 그 밖에 이와 유사한 것으로서 대통령령이 정하는 날 이라 함은 별표 7의 기준시가 과세기준일을 말하며, 기준시가 과세기준일이 없는 경우에는 「공익사업을 위한 토지 등의 취득 및 보상에 관한 법률」의 규정에 의하여 보상계획을 공고한 날을 말한다.

다. 사실관계 및 판단

청구인은 쟁점토지를 취득함에 있어 쟁점토지가 소재한 지역이 토지투기지역으로 지정되기 이전에 쟁점토지를 취득하였고, 공익사업용으로 OO지방공사에 협의매수된 것이므로 조세특례제한법 제85조 의 규정에 의하여 쟁점토지의 양도차익을 기준시가로 산정할 수 있는 경우에 해당된다고 주장하므로 이에 대하여 살펴본다.

(1) 조세특례제한법 제85조 의 규정에 의하면, 소득세법령에 의한 지정지역내의 부동산의 경우라도 공익사업 관련 법률에 의하여 양도하는 부동산의 경우에는 당해 법률에 의하여 부동산이 속한 사업지역에 대한 예정지구 등의 지정일(관계 행정기관의 장이 관보 또는 공보에 고시한 날을 말하며, 그 고시한 날이 사업인정고시일부터 소급하여 2년 이내인 경우에는 사업인정고 시일부터 소급하여 2년이 되는 날, 그 고시한 날이 소득세법령에 의한 지정지역 지정 후 도래하는 경우에는 지정지역을 지정한 날을 말한다) 전에 취득하여 2006년 12월 31일 이전에 수용된 부동산의 경우 에는 그 양도가액 및 취득가액을 기준시가에 의할 수 있다고 규정하고 있다.

(2) 청구인이 쟁점토지를 취득한 날은 2003.6.11이고, 쟁점토지가 속하는 OOO OOO 지역이 소득세법시행령 제162조의3 규정에 의한 지정지역으로 지정고시된 날이 2003.8.18이라는 사실에 대하여는 청구인과 처분청간에 다툼이 없고, 수용 및 보상금 지급사실 확인서에 의하면, 쟁점토지는 산업입지 및 개발에 관한 법률 제7조의3 규정에 의해 2004.9.30 OO OO 일반지방산업단지로 사업인정고시(OOO OO OOOOOOOOOO)됨에 따라 2005.5.30 OOOOOOO가 쟁점토지를 2,256,721천원에 협의매수한 사실이 확인된다.

(3) 위의 사실관계 및 관련법령을 종합하여 살펴보면, 조세특례 제한법 제85조 의 규정에 의한 기준시가 과세요건을 충족하기 위해서는 해당 부동산이 속한 사업지역에 대한 사업인정고시일부터 소급하여 2년이 되는 날(소득세법에 의한 지정지역을 지정한 날이 동 사업인정고시일로부터 소급하여 2년이 되는 날 이전인 경우에는 지정지역을 지정한 날) 이전까지 해당 부동산을 취득하여야 하는 것이나, 청구인은 쟁점토지를 쟁점토지가 소재한 지역이 토지투기지역 으로 지정된 2003.8.18 전인 2003.6.11 취득하였으나, 쟁점토지가 속한 사업지역에 대한 사업인정고시일(2004.9.30)부터 소급하여 2년이 되는 날(2002.9.30) 이후에 취득하였으므로 위의 규정에 의한 기준시가 과세요건을 충족하지 못한 사실이 확인된다.

(4) 따라서, 처분청이 쟁점토지의 양도차익을 실지거래가액으로 산정하여 과세한 이 건 처분은 잘못이 없다고 판단된다.

4. 결 론 이 건 심판청구는 심리결과 청구인의 주장이 이유없으므로 국세기본법 제81조 및 제65조 제1항 제2호의 규정에 의거 주문과 같이 결 정한다.